Assalamu 'alaikum wr. wb
Benar, Rasulullah saw telah mengajarkan banyak do'a dalam satu rukun shalat (dalam ruku', Rasulullah saw mengajarkan lebih dari 6 do'a, dalam sujud, Rasulullah saw mengajarkan lebih dari 12 do'a dan yang lainnya).
Dan selama do'a -do'a tersebut diriwayatkan dalam hadits yang shahih, maka boleh saja kita memilih sesuai dengan keinginan kita untuk kita baca dalam shalat kita, meskipun do'a yang kita baca pada rok'at pertama berbeda dari do'a yang kita baca pada roka'ayt yang kedua.
Wallahu a'lam bishashawab.
Wassalamu 'alaikum wr. wb.